La première Honda de cross, la CR 250 M Elsinore, a été commercialisée en 1973 bien après les autres marques japonaises. Suivant les habitudes de Honda, le modèle mis sur le marché, tout de suite performant et abouti, remporte de beaux succès aux États-Unis. Mais, dans le domaine ultra compétitif du motocross, et en particulier dans ces années 1970 - 80 ou la technique évolue très rapidement, les premières CR 250 M vont vite être dépassées par la concurrence. 

Un tout nouveau modèle radicalement différent présenté en 1978 va assurer la transition esthétique et technique vers les années 80. Le moteur, agressivement peint en rouge, développe maintenant 37 ch contre 29 ch pour la première version de la CR 250 M et le débattement des suspensions commence son ascension vers des valeurs qui atteindront plus de 300 mm. Les amortisseurs arrière sont très inclinés vers l'avant et la fourche avant est à axe déporté. 1978 est aussi le début d'une véritable importation des CR en France. Encore de gros changement en 1981 avec l'apparition de la suspension arrière monoamortisseur Pro-Link et du refroidissement liquide, ce qui lui permet d'afficher 40 ch et surtout de les conserver sur toute la longueur d'une manche. Pour cette première version, le radiateur de refroidissement se trouve très haut, pratiquement derrière la plaque numéro. En 1982, le moteur perd sa belle couleur rouge, le radiateur descend à sa position définitive et le nom Elsinore est abandonné. Un frein à disque apparaît en 1984 et la 250 CR inaugure le système ATAC permettant de lisser la courbe de couple du moteur et de le rendre plus facile et plus efficace. Le moteur est revu en profondeur en 1986, la puissance grimpe à 48 ch et l'arrière gagne un frein à disque. L'échappement adopte une position basse dite « Low-boy » en 1988, passant sur le côté du moteur est non plus sur le dessus. Une fourche inversée, adoptée en 1989, sera une des dernières grosses nouveautés jusqu'en 1997 où arrive la nouvelle 250 CR qui révolutionne le monde du motocross avec, pour la première fois, un cadre périmétrique en aluminium. La puissance qui culmine à 58 ch, n'est plus très loin des 65 ch de la 500 CR !

La 250 CR va continuer à évoluer par petites touches jusqu'en 2007, en parallèle de l'apparition de la CR 450 F équipée d'un moteur quatre temps. En 2003, de nouvelles catégories sont mises en place par la FIM, les 450 quatre temps remplacent les 250 deux temps, sonnant par là le glas "cylindres à trous" et la fin d'une longue lignée. Bizarrement, malgré une quasi-domination dans les années 80 aux États-Unis, il faudra attendre les années 90 pour que la CR 250 remporte quelques podiums en Championnat du monde tandis que Honda se concentre sur les 500 en Grand Prix dans les années 80.